Стоп-кокцид 2,5% относится к антикокцидийным препаратам группы триазинтриона. Толтразурил, входящий в состав препарата, обладает широким спектром кокцидиоцидного действия на все стадии внутриклеточного развития (мерогонии и гамогонии) кокцидий (эймерий), паразитирующих у птиц, в том числе Eimeria acervulina, Eimeria brunetti, Eimeria necatrix, Eimeria mitis, Eimeria adenoides, Eimeria meleagrimitis, Eimeria anceris, Eimeria truncata, включая кокцидий, устойчивых к другим антикокцидийным препаратам. Механизм действия толтразурила заключается в блокировании дыхательных ферментов и оказании повреждающего действия на митохондрии и процессы деления ядра кокцидий. Толтразурил, нарушая процесс формирования макрогаметоцитов, вызывает гибель паразита. После перорального введения препарата толтразурил медленно всасывается и оказывает кокцидиоцидное действие на слизистой и подслизистой оболочках желудочно-кишечного тракта.